Žaidimas yra sukurtas slaptą laboratoriją įsikūręs ant vandenyno dugne. Čia vienatvės gyveno ekscentrišką mokslininką, patirtimi ir eksperimentai kolegos kaltinti jį. Jo pagrindinė užduotis buvo sukurti gyva būtybe suteiktas protas ir metų jis tai padarė. Bet tuo pačiu metu kūrėjas dingo paslaptingomis aplinkybėmis, paliekant Goo (šis pavadinimas jau gavo savo palikuonių) ir laukti, kol jį praleisti. Herojus pavargę hanging out kolbą fotoaparate ir išeiti iš jos, jis išvyko į komplekso kelionė rasti pėdsakai dingusio draugo. Gebėjimas pasirinkti elastingumo laipsnį padės įveikti įvairias kliūtis, kad galėtų susidoroti su priešų ir įsiskverbti į kur paprastas žmogus ar kaip ne gauti.